Das Unternehmen brachte vor mehr als 15 Jahren ein auf DOS basierendes Praxisverwaltungs-System auf den Markt. 1996 folgte die erste Version der Windows-Lösung PDE-TOP. Im Jahr 2001 wurde PDE-TOP durch die Kommunikationsplattform ComDox erweitert, 2002 wurde das erste Arztnetz in Deutschland (40 Praxen) mit der Vollversion PDE-TOP ausgestattet, Tendenz seitdem stetig steigend.
Heute betreut die MCS Pie Data GmbH über 1200 Anwender mit ihren Softwarelösungen für niedergelassene Ärzte, Arztnetze, überörtlichen Teilgemeinschaftspraxen, MVZ und Ambulanzen.
Seit dem 01.01.2006 ist MCS Pie Data mit Sitz im nordrhein-westfälischen Dorsten Mitglied der MCS-Firmengruppe.